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马氏珠母贝EST微卫星的筛选

2008-03-15分类号:S917.4

【作者】石耀华  洪葵  郭希明  王嫣  侯占辉  顾志峰  王爱民  
【部门】中国热带农业科学院热带生物技术研究所  中国热带农业科学院热带生物技术研究所  Haskin Shellfish Research Laboratory Institute of Marine and Coastal Sciences  Rutgers University  6959 Miller Avenue  Port Norris  NJ08349  USA  海南省热带水生生物技术重点实验室  海南省热带水生生物技术重点实验室  海南省热带水生生物技术重点实验室  海南省热带水生生物技术重点实验室  热带作物生物技术国家重点实验室  华南热带农业大学  海南海口571101  海南省热带水生生物技术重点实验室  ...
【摘要】构建了马氏珠母贝的血液、足、鳃、胃、肝、心脏、外套膜、珍珠囊和感染多毛虫马氏珠母贝的血液(血感)等9个组织的cDNA文库,测序获得了6979个EST序列,从中查找到了268个重复序列,隶属于243个EST,含微卫星的EST数占EST总数的3.48%。珍珠囊cDNA文库含微卫星的序列所占比例最高,为6.16%,血感的最低,为1.65%。双碱基重复序列130个,占48.5%,(AT/AT)n类型最常见;三碱基类型的83个,占约31%,其中(AAT/ATT)n和(AAG/CTT)n较多;四碱基重复的有30个,占11.2%,(AAAT/ATTT)n占了该类型的约50%。一共能够设计151对微卫星引物,...
【关键词】马氏珠母贝  EST-SSR  分子遗传学
【基金】国家“八六三”高技术研究发展计划(2006AA10A409); 国家自然科学基金(40676075;30460105); 国际科技合作重点项目计(2004DFA07200); 博士后科学基金(2005037627); 海南省自然科学基金(80412)
【所属期刊栏目】水产学报
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