基于16S rRNA部分序列探讨12种鲹科鱼类的分子系统进化关系
2008-11-15分类号：S917.4
【部门】宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室 宁波大学生命科学与生物工程学院生物系 华南农业大学动物科学学院
【摘要】通过PCR扩增获得了中国海域的鲹科(Carangidae)8属9种的线粒体16S rRNA序列片段约598bp碱基,结合来自GenBank的3种鲹科鱼类的相应片段序列,并以大斑石鲈为外群,生成供系统发育分析的序列矩阵,利用MEGA version3.0软件分析序列的碱基组成、差异百分比和转换/颠换值等,应用最大简约法和邻接法构建系统树。结果显示:(1)鲹科鱼类的16S rRNA序列片段生成的序列矩阵中发现有碱基的插入和缺失,共有146bp变异位点,转换/颠换值为2.17,表明基因序列的突变未达到饱和,碱基平均差异为8.22%;(2)支持鲹科下设四个亚科(鲹亚科,亚科,鲳鲹亚科,鲹亚科)阶元的分...
【关键词】鲹科 线粒体DNA 16S rRNA序列 系统发育
【基金】国家自然科学基金(30771652); 华南农业大学校长基金(K06141)
【所属期刊栏目】水产学报
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