3种鲳属鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化
2008-05-15分类号：S917.4
【部门】中国水产科学研究院东海水产研究所 农业部海洋与河口渔业重点开放实验室 中国水产科学研究院东海水产研究所 农业部海洋与河口渔业重点开放实验室 中国水产科学研究院东海水产研究所 农业部海洋与河口渔业重点开放实验室 中国水产科学研究院东海水产研究所 农业部海洋与河口渔业重点开放实验室 上海200090华东师范大学生命科学学院 上海200063 上海200090 上海200090 上海200090
【摘要】对采自东海的银鲳(Pampus argenteus)、翎鲳(P.punctatissimus)和中国鲳(P.chinensis)3种鲳属鱼类的线粒体COI基因序列片段进行扩增和序列测定,得到603bp的基因片段,编码201个氨基酸,碱基T、C、A、G平均含量分别为34.2%、22.3%、25.9%和17.6%。所得序列共定义12个单倍型,中国鲳只有1个单倍型,银鲳3个单倍型,翎鲳8个单倍型,在这12个单倍型中共检测到109个变异位点。3种鲳密码子的使用均存在明显的偏向性,且同义密码子使用偏向性高度一致。银鲳和中国鲳的遗传距离最大(0.165~0.168),与翎鲳的遗传距离次之(0.151~0....
【关键词】鲳属 线粒体COI基因 序列变异 系统进化 自然选择
【基金】国家科技基础条件平台建设子项目课题(2006DKA30470_004); 上海市科技兴农重点攻关项目[沪农科攻字(2004)第8-3号]; 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2007M22)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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