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10种海参16SrDNA序列多样性及其亲缘关系分析

2008-09-15分类号:S917.4

【作者】费来华  李赟  陈家鑫  
【部门】中国海洋大学  中国水产科学研究院黄海水产研究所  
【摘要】运用PCR扩增10种海参的16SrDNA部分序列,并测序。获得大小为566bp的序列,利用DNAsp4.0软件分析比较10种海参的碱基组成、各碱基变异位点数、插入或缺失位点数,并采用MEGA4.0软件分析彼此间的遗传距离。结果发现,10种海参富含AT碱基,A+T的含量平均为57.0%,不同种海参间发生碱基转换、颠换及发生插入或缺失变异的位点数差异很大,10种海参彼此间的遗传距离在0.007~0.316之间。所得结果与GenBank中10种海参的相应序列进行比对分析,同时用MEGA4.0和PAUP*4.0软件构建进化树,分析其亲缘关系。结果表明,利用16SrDNA序列的差异可以将分属于海参科(H...
【关键词】海参  16SrDNA  系统发生
【基金】中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室开放课题.
【所属期刊栏目】中国水产科学
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