圆白鲳消化道菌群PCR-DGGE基因指纹图谱构建
2008-03-15分类号:S917.1
【部门】中国农业科学院饲料研究所 中国农业科学院饲料研究所 中国农业科学院饲料研究所 中国农业科学院饲料研究所 北京100081 北京100081 北京100081 北京100081
【摘要】采取免培养的16S rDNA梯度凝胶电泳(DGGE)技术对集约化海水网箱养殖圆白鲳Ephippus orbis(体重17.7±3.0 g)包括胃壁、胃内容物、肠壁及肠内容物在内的消化道菌群结构进行了初步分析。DGGE指纹图谱显示圆白鲳胃内容物、胃壁及肠壁有7条明显条带,肠内容物有6条明显条带,提示圆白鲳消化道可能存在着较丰富细菌群落;针对指纹图谱的聚类分析表明胃内容物及肠内容物细菌组成相似度最高达90.0%,而胃壁与肠壁的相似度相对较差达80%。半定量分析表明圆白鲳消化道菌群相对丰度的变异系数均大于47.4%,暗示圆白鲳消化道趋向于以一种或极少数种细菌占统治地位。
【关键词】圆白鲳 16SrDNA DGGE指纹图谱
【基金】国际科技合作重点项目计划(2004DF100229); 中国博士后科学基金(2005037625); 淡水生态与生物技术国家重点实验室开放课题(2005FB05); 广东省自然科学基金(05300945)
【所属期刊栏目】上海水产大学学报
文献传递