油茶种子水通道蛋白CoPIP1-1的鉴定与分析
2008-12-15分类号:S794.4
【部门】中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室
【摘要】以构建的油茶cDNA文库为基础,采用交错延伸PCR技术,分离克隆到一个水通道蛋白基因的编码序列(coding sequence,CDS),它编码一个287aa的跨膜蛋白(GenBank蛋白质id:ACF39901)。该蛋白可能由2条基因(GenBank登录号:EU850810、EU850811)编码,这2个基因具有相同的CDS和3′-UTR,但5′-UTR不同,其中之一多了2个小的插入片段。经对该蛋白的同源性比对和特征性基序分析,推测这个水通道蛋白属于质膜内在蛋白成员,定名为CoPIP1-1。通过同源建模,论证CoPIP1-1的水通道活性与通道口的(去)覆盖有关。N端与D环、B环的静电势作用导...
【关键词】油茶 水通道蛋白基因 cDNA文库 水通道活性 生物信息学 同源建模
【基金】中南林业科技大学研究生创新基金(2006bx01); 湖南省教育厅研究生创新基金; 国家“十一五”科技支撑项目(2006BAD18B0204,2006BAD01A1706)
【所属期刊栏目】林业科学
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