1个油茶Y_2SK_2型脱水素的全长cDNA克隆及生理功能的预测
2008-10-15分类号：S794.4
【部门】中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室
【摘要】以构建的油茶EST文库为基础,采用电子克隆技术,分离克隆一个脱水素基因的全长cDNA序列,该基因的cDNA全长1406bp,含一个600bp的CDS,编码200aa的小分子蛋白。推测该基因编码蛋白的分子质量为21ku,等电点7,暂命名为CoDHNI。同源性分析发现该基因的编码蛋白具有2个Y-片段(DEYGNP),1个S-片段(SGSSSSSS),2个K-片段(KIKEKLPG),属于典型的Y2SK2型脱水素。经Blast比对,发现富含苏氨酸的Thr-区在各物种间变异显著,推测该区为油茶所特有,有利于在被保护的大分子表面形成水合层;同时还发现一个十分保守的基序:EDDGQGGRRKK,可能有利于...
【关键词】油茶 脱水素基因 cDNA文库 RACE 生理功能 生物信息学
【基金】国家“十一五”科技支撑项目(2006BAD18B0204,2006BAD01A1706); 国家自然科学基金项目(30371184); 湖南省科学技术厅科技计划项目(06FJ4111)
【所属期刊栏目】林业科学
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