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基于SSR荧光标记技术的玉米群体混合样本基因频率分析方法

2008-12-10分类号:S513

【作者】刘晓鑫  谢传晓  赵琦  路明  曲延英  张滨  梁业红  张世煌  
【部门】中国农业科学院作物科学研究所玉米研究中心/农业部作物遗传育种学重点实验室  新疆农业大学  首都师范大学  
【摘要】【目的】建立玉米群体混合样本等位基因及其频率的分析方法。【方法】采用ABI全自动遗传分析仪,利用5′端荧光标记的SSR引物,通过混合样本中PCR扩增产物检测峰高与丰度对应,分析基因频率。【结果】与聚丙烯酰胺凝胶电泳银染法相比,ABI全自动遗传分析仪的检测灵敏度高。20个供试玉米群体中,荧光引物Phi072(6-Fam)共检测到82个等位基因位点,平均每个群体4.1个;引物Phi084(Hex)检测到43个等位基因位点,平均每个群体2.15个。多重PCR(multiplex PCR)荧光SSR检测结果显示,可以明确区分不同等位基因。荧光SSR能准确地读出片段大小,定量PCR扩增产物的丰度。用Ge...
【关键词】荧光SSR  玉米群体  混合样本  基因频率
【基金】CGIAR Generation Challenge Program项目; 科技部“863”项目(2006AA10Z191)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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