玉米黑粉菌基因组编码蛋白作用位点的计算机预测
2008-02-28分类号：S435.13
【部门】云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室 云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室 云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室 云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室 云南昆明650201 云南昆明650201 云南昆明650201 云南省农业科学院经济作物研究所 云南昆明650205 云南昆明650201 云南农业大学农业与生物技术学院 云南昆明650201
【摘要】利用已公布的玉米黑粉病菌基因组全序列数据及信号肽预测软件SignalP v3.0、亚细胞器中蛋白定位分布预测软件Tar-getP v1.01、跨膜螺旋结构预测软件TMHMMv2.0和膜锚定位点预测软件Big-PI Predictor预测分析了玉米黑粉病菌基因组编码蛋白的作用位点。结果表明,在6522个ORF中,具有分泌功能的有543个,占全基因组基因总数的8.3%;作用位点在线粒体的有1552个,占全基因组基因总数的23.4%;具有跨膜结构的有1269个,占全基因组基因总数的19.5%;锚定在膜上的有56个,占全基因组基因总数的0.9%。
【关键词】玉米黑粉病菌 基因组 亚细胞作用位点 计算机预测
【基金】
【所属期刊栏目】西南农业学报
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