香蕉穿孔线虫28S rRNA基因的D2/D3区序列分析
2008-10-15分类号:S432.45
【部门】中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室 中国农业科学院研究生院
【摘要】采用线虫通用引物D2A和D3B对9个香蕉穿孔线虫种群的核糖体DNA28S大亚基的D2/D3区进行了扩增,获得的片段长度约为780bp,克隆测序后使用UPGMA法进行聚类分析和构建系统发育树。结果表明9个线虫种群D2/D3区核苷酸序列相似性为99.13%,其中8个群体的序列与越南报道的香蕉穿孔线虫近源种(Radopholus sp.7B VietNam)的D2/D3区核苷酸序列(DQ328712)相似性为97.46%,说明香蕉穿孔线虫D2/D3区具有较大的保守性。聚类分析结果表明,RSHN12r、RSSH、RSHL、RSHK、RSLZ、RSSZ、RSHN13、RSHN12p等8个种群聚为一类,亲...
【关键词】香蕉穿孔线虫 28S rRNA基因 D2/D3扩展区域
【基金】国家自然科学基金(30671363); 国家“十一五”科技支撑计划(2006BAD08A14,2006BAD08A08); 公益性行业(农业)科研专项(ny-hyzx07-050)资助
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
文献传递