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草莓斑驳病毒分子变异及PCR检测技术研究

2008-07-10分类号:S436.68

【作者】杨洪一  李丽丽  代红艳  张志宏  
【部门】东北林业大学生命科学学院  沈阳农业大学园艺学院  沈阳农业大学园艺学院  沈阳农业大学园艺学院 哈尔滨150040  沈阳110161  沈阳110161  沈阳110161
【摘要】【目的】明确草莓斑驳病毒(Strawberry mottle virus,SMoV)的分子变异特点;探索利用嵌套PCR和转录增强技术检测SMoV的方法。【方法】利用RT-PCR扩增SMoV3′非编码区(non-coding region,NCR)和大外壳蛋白(large coat protein,LCP)基因特异片段,并对扩增产物进行克隆测序。利用生物信息学软件分析不同地区分离物变异特点及系统发育关系。参考测序结果,在SMoV基因组保守区设计引物,利用嵌套PCR和转录增强技术检测SMoV。【结果】获得了SMoV中国分离物的NCR区和部分LCP基因核酸序列,不同分离物部分LCP基因核酸序列同源性...
【关键词】草莓斑驳病毒  RT-PCR  嵌套PCR  变异  系统进化分析
【基金】国家自然科学基金项目(30200187)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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