适用于大豆疫霉菌遗传分析的新EST-SSR标记
2008-08-10分类号:S435.651
【部门】中国农业科学院作物科学研究所 国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程 吉林大学农学院
【摘要】【目的】开发大豆疫霉菌SSR标记,为深入了解大豆疫霉菌遗传变异提供理想分析工具。【方法】用SSRIT软件对28197条大豆疫霉菌EST进行SSR搜索,选择含有SSR的合适EST设计、合成引物和PCR扩增。【结果】发现1454条EST含有SSR,其中3个碱基重复基元类型最多,有855个,占鉴定总数的54.3%。设计合成140对引物,用10个大豆疫霉菌菌株基因组DNA进行PCR检测,有111对引物(79.3%)扩增出SSR特征条带。通用性检测表明有33对引物在检测的1个或多个其它疫霉菌或腐霉菌中产生扩增产物。【结论】大豆疫霉菌EST含有丰富的SSR位点,本研究从EST中开发了111个新大豆疫霉菌S...
【关键词】大豆疫霉菌 表达序列标签(EST) SSR标记 通用性
【基金】国家重点基础研究发展规划“973”项目(2002CB111406)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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