利用16S rRNA序列鉴定分离自开菲尔粒的一株乳杆菌
2008-02-15分类号:Q93-33
【部门】中国农业大学食品科学与营养工程学院 中国农业大学食品科学与营养工程学院 中国农业大学食品科学与营养工程学院 中国农业大学食品科学与营养工程学院 中国农业大学食品科学与营养工程学院 北京100083 北京100083 北京100083 北京100083 北京100083
【摘要】对菌株H13的16S rRNA序列进行克隆和测序,并以此为基础构建菌株H13的系统发育树,对菌株H13进行鉴定。应用PCR技术,扩增H13菌株的16S rRNA基因,将其与pEASY-T载体相连接,用Sanger双脱氧链终止法测定序列并将16S rRNA序列与GenBank所选择的同属及非同属的菌进行同源性比较。结果表明:H13菌株16S rRNA基因序列同源性与乳杆菌属10株菌均在89%以上,与所选的植物乳杆菌和类植物乳杆菌的同源性高达99.5%和99.2%,与其他8株乳杆菌属菌株的同源性都小于97%,可进一步确定其为植物乳杆菌或类植物乳杆菌。系统发育进化树结果表明,H13与植物乳杆菌的同源...
【关键词】开菲尔粒 16S rRNA 植物乳杆菌 系统发育树
【基金】国家863项目(2006AA10Z343); “十一五”科技支撑项目(2006BAD05A03)
【所属期刊栏目】中国农业大学学报
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