生物信息学技术分析并克隆超级稻生长素结合蛋白cDNA
2008-07-15分类号:Q785
【部门】湖南农业大学湖南省植物激素与生长发育重点实验室 佛山科学技术学院 湖南农业大学生物科学技术学院
【摘要】为进一步研究超级稻的生长素结合蛋白,采用生物信息学方法获得其全长cDNA序列,并进行分析;对全长序列进行了全长验证。从数据库搜索获得了一条水稻cDNA序列,含一个推测的206个氨基酸的开放阅读框,与其它植物的ABP1cDNA序列和ABP1蛋白质序列具有明显的同源性,并且其推测编码的蛋白质的各种性质,类似于其它植物的ABP1。结果显示,该序列为水稻的ABP1cDNA。以该序列为指导,利用RT-PCR扩增超级稻ABP1cDNA,并克隆测序,其序列与电子搜索结果一致。
【关键词】生物信息学 超级稻 生长素结合蛋白 克隆
【基金】国家自然科学基金《植物激素;植酸与杂交水稻籽粒灌浆的关系及调控的研究》(编号:30600049)
【所属期刊栏目】农业现代化研究
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