cDNA微阵列鉴定差异表达基因的可靠性分析
2008-06-28分类号：Q78
【部门】华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室国家蔬菜改良中心华中分中心 华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室国家蔬菜改良中心华中分中心 潍坊学院生物工程学院 华中农业大学园艺植物生物学教育部重点实验室国家蔬菜改良中心华中分中心 湖北武汉430070 潍坊市农业科学院 山东潍坊261061 湖北武汉430070 山东潍坊261061 湖北武汉430070
【摘要】应用马铃薯晚疫病水平抗性相关的1 009条表达序列标签(ESTs)所制备的cDNA微阵列和荧光信号Cy3,Cy5杂交系统,通过同一样品RNA的自身比较试验及与不同样品RNA的差异分析试验,对该技术的重复性和可靠性进行了验证分析。结果表明,在自身比较试验中,芯片杂交的假阳性率仅为0.79%,相关系数高达0.981 1;在差异分析试验中,同向标记、正反向标记、同一芯片内2个重复杂交结果的相关系数分别为0.966 0,0.889 5,0.980 2。研究结果证实,cDNA芯片技术具有高度的可靠性,可以鉴定出显著差异表达基因,并构建高质量的基因表达数据库,通过3次生物学重复和2次技术重复试验(采用正、...
【关键词】cDNA微阵列 差异表达基因 可靠性
【基金】国家自然科学基金项目(39970464); 国家“948”计划项目(201022)
【所属期刊栏目】华北农学报
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