【摘要】重点学科建设水平与高校可持续发展进程息息相关。近年来,各级政府特别是省级财政向高校投入了大量的重点学科建设地方财政专项资金。笔者从专项资金管理角度出发,以北京市、广东省、辽宁省等情况为例进行比较分析,探讨重点学科建设地方财政专项资金的管理体制、资源配置与学科建设等环节中存在的问题,提出理顺管理体制、将资源配置与学科规划相结合等建议,以期对提高重点学科建设地方财政专项资金的资源配置水平和管理效率有所裨益。