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黄鳍鲷基因组微卫星的分离

2007-03-30分类号:S917.4

【作者】夏军红  朱彩艳  苏天凤  江世贵  
【部门】中国水产科学研究院南海水产研究所  中国水产科学研究院南海水产研究所  中国水产科学研究院南海水产研究所  中国水产科学研究院南海水产研究所 广东广州510300  广东广州510300  广东广州510300  广东广州510300
【摘要】采用磁珠富集法构建黄鳍鲷(Acanthopagrus latus Houttuyn)基因组微卫星富集文库。共挑选60个克隆进行测序,分析发现58个克隆分别含(GA)n或(CA)n两碱基重复单元。进一步通过序列比对,最终获得41个具有特异微卫星序列的阳性克隆。其中,23个克隆含有(GA)n或(CT)n两碱基重复序列,17个克隆含有(GT)n或(CA)n重复序列,另1个含有以上两种重复类型。获得的微卫星序列中,单一型及间断型序列各有20条,另有1条属于复合型序列。序列长度为117~512 bp,平均259 bp。微卫星核心序列两碱基重复5到38次,绝大多数序列重复次数大于10。基于微卫星两端的侧翼...
【关键词】黄鳍鲷  基因组  微卫星
【基金】国家自然科学基金资助(30500376); 中国水产科学研究院重点开放实验室开放基金(170)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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