罗氏沼虾白斑综合征病毒囊膜蛋白VP28基因的克隆及分析
2007-05-15分类号:S945.41
【部门】苏州大学生命科学学院 苏州大学生命科学学院 苏州大学生命科学学院 苏州大学生命科学学院 苏州大学生命科学学院 江苏省水生动物疫病控制中心 苏州大学生命科学学院 苏州市水产研究所有限公司 苏州大学生命科学学院 江苏苏州215123 江苏苏州215123 江苏苏州215123 江苏苏州215123 江苏苏州215123 南京210036 江苏苏州215123 江苏苏州215107 江苏苏州215123
【摘要】根据已公布的罗氏沼虾白斑综合征病毒(WSSV)囊膜蛋白VP28基因序列设计一对特异性引物,从疑似患白斑病毒病的罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)中提取总DNA,并以此为模板,经PCR扩增、克隆并测序后将该片段通过GenBank比对,证实为WSSV的VP28基因;与20个已公布的WSSV VP28进行同源性比较,结果显示:从中国对虾、斑节对虾、南美白对虾、日本对虾、波纹龙虾提取的病毒株聚为一类,印度对虾WSSV VP28为另一类,罗氏沼虾WSSV VP28又单独为一类。根据测序结果推测VP28蛋白的二级结构在氨基酸的7~29区间可能为跨膜螺旋区,且该区域高度保守。
【关键词】VP28基因 克隆 序列分析 蛋白质二级结构
【基金】苏州市攻关课题(SNZ0518); 国家973项目(2005CB121000)
【所属期刊栏目】淡水渔业
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