日本囊对虾基因组小卫星的特征分析
2007-03-15分类号：S917.4
【部门】中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室 山东青岛266071 山东青岛266071 山东青岛266071 山东青岛266071 山东青岛266071 山东青岛266071
【摘要】为了分析日本囊对虾基因组中小微星序列的分布特征并开发小卫星标记,构建了日本囊对虾随机基因组文库,对其中片段长度为400-1 000bp的3 395个克隆测序,共获得总长度为1 606 711bp的DNA序列。在序列拼接后的2 815个克隆中,筛选到487个小卫星序列,其序列总长度占测序序列总长度的3.97%。小卫星序列中,以12bp重复单位的序列数量最多(8.62%),总体趋势表现为重复单位越长,相应的重复序列数目越少(R=-0.826,P<0.01)。小卫星重复单位拷贝数分布范围以8bp重复单位最广(3.1-47.6),其次是10bp(2.5-44),再次是12bp(2.2-28)。平均拷贝...
【关键词】日本囊对虾 串联重复序列 小卫星 重复单位 拷贝数
【基金】国家“八六三”高新技术发展计划(2005AA603210,2003AA603032)
【所属期刊栏目】水产学报
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