猪源新城疫病毒SP13株的F基因克隆及序列分析
2007-05-18分类号：S852.65
【部门】福建出入境检验检疫局 福建省农业科学院畜牧兽医研究所 福建出入境检验检疫局 福州大北农生物技术有限公司 福建省农业科学院畜牧兽医研究所 福建省农业科学院畜牧兽医研究所 福建省农业科学院畜牧兽医研究所 福建福州350001 南京农业大学动物医学院 江苏南京210095 福建福州350013 福建福州350001 福建福州350014 福建福州350013 福建福州350013 福建福州350013
【摘要】采用RT-PCR方法对猪源新城疫病毒(NDV)SP13株的F基因进行了扩增与克隆,并测定出F基因的核苷酸全序列,推导出氨基酸序列.F基因全长为1662 bp,单一的开放阅读框,编码553个氨基酸的长肽,裂解位点的氨基酸序列为112G-R-Q-G-R-L117,与弱毒株在这一区域的序列(112G-R/K-Q-G/S-R-L117)相符;F蛋白有6个潜在的糖基化位点和13个Cys残基位点,其疏水构型有3个强疏水区.通过同源率、系统发育、致病性、疏水性和抗原性等比较分析的结果表明,SP13与LaSota、Clone 30株不但同源性达到99.9%,而且在致病性、疏水性和抗原性等方面也极为相似.
【关键词】猪源 新城疫病毒 F基因 克隆 序列分析 系统发育分析
【基金】福建省自然科学基金资助项目(Z0516088)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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