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多枝赖草基因组Mb级DNA制备和酶切方法的优化

2007-12-28分类号:S543.9

【作者】徐粤宇  周玉雷  赵茂林  王志平  王克武  张艳  
【部门】首都师范大学  甘肃农业大学  北京市农林科学院  北京市土肥工作站  北京市土肥工作站  首都师范大学 北京100037  甘肃兰州730070  北京100097  北京100029  北京100029  北京100037
【摘要】Mb级DNA的制备和酶切是构建YAC,PAC,BAC,BIBAC和TAC文库与大尺度物理图谱的基础。以浓度0.4%(m/m)NaCl人工模拟盐池中生长的多枝赖草再生叶为材料提取细胞核,经钢丝细胞筛过滤,多次回收滤渣和离心上清中的细胞核,相差显微镜调浓度达108个/mL后,经LMP包埋,蛋白酶K降解核蛋白,脉冲电泳纯化回收后,在LMP胶块中2 Mb以上DNA的浓度约为250 ng/μL。在胶中经Hind III部分酶切再用脉冲电泳回收不同大小范围的DNA,电洗脱浓缩除盐后浓度约为25 ng/μL。用此方法得到的核DNA不但无细胞器DNA等的污染,而且浓度高,可直接用于各种人工染色体文库的构建。
【关键词】多枝赖草  Mb级DNA  基因组文库  脉冲交变电场电泳  酶切
【基金】国家自然科学基金(3037090530571135); 北京市自然科学基金(5032009)
【所属期刊栏目】华北农学报
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