水稻瘤矮病毒基因组第6片段(S6)序列测定与分析
2007-11-10分类号：S435.111
【部门】华南农业大学植物病毒研究室 华南农业大学植物病毒研究室 华南农业大学植物病毒研究室 华南农业大学植物病毒研究室 广州510642海南出入镜检验检疫局热带植物隔离检疫中心 海口570311 广州510642 广州510642 广州510642
【摘要】【目的】了解水稻瘤矮病毒(RGDV)基因组结构与功能。【方法】根据已报道的RGDV基因组各片段末端序列及其反向重复特性,采用4轮RT-PCR的方法扩增RGDV基因组第6片段(S6),用生物学软件进行序列分析。【结果】得到了该病毒S6的全序列。S6全长1651bp,G+C含量39.13%,包含一个长的ORF,起始于第25位,终止于第1497位,编码490个氨基酸,分子量为53.3kD。【结论】该蛋白与伤瘤病毒(WTV)的P7的相似性为30.0%,与水稻矮缩病毒(RDV)的P7的相似性为31.7%。这是RGDVS6全序列的首次报道。
【关键词】植物呼肠孤病毒 水稻瘤矮病毒(RGDV) 基因组第6片段(S6) 序列分析
【基金】国家自然科学基金(30370929); 广东省自然科学基金(C036845)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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