水稻与白叶枯病菌互作的基因表达谱分析与差异性表达基因的识别
2007-02-10分类号:S435.11
【部门】中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室 中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室 中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室 中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室 北京100094 北京100094 北京100094 北京100094
【摘要】【目的】从基因组水平上阐明水稻在与白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)感病互作条件下基因表达反应的特征。【方法】用cDNA-AFLP方法对Xoo接种处理不同时间的水稻细胞进行基因表达谱分析。【结果】在测定的大约4 000个水稻cDNA片段中,363个(9.1%)是差异性表达的,其中295个受Xoo诱导上调表达,68个被抑制下调表达。根据在不同互作时间点的表达特征,它们可分为7种表达类型。对31个差异片段的序列同源性进行分析,发现它们在己公布的水稻全基因组中完全相同的序列,但只有10个基因具有已知或推断的生物学功能,其余21个基因功能未知。用荧光实时定量...
【关键词】水稻 白叶枯病菌 cDNA-AFLP 表达谱 差异性表达基因
【基金】国家自然科学基金项目(30370922); 中国农业科学院“杰出人才计划”项目
【所属期刊栏目】中国农业科学
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