盐桥与全基因组微生物耐热性的关系研究
2007-06-15分类号:Q936
【部门】江南大学信息工程学院 江南大学工业生物技术教育部重点实验室 江南大学信息工程学院 江南大学工业生物技术教育部重点实验室 江南大学信息工程学院 无锡214122 江南大学工业生物技术教育部重点实验室 无锡214036 无锡214036 江南大学生物工程学院 无锡214036 无锡214122 无锡214036 江南大学生物工程学院 无锡214036 无锡214122
【摘要】挑选了NCBI COG数据库中具有全基因组的单细胞微生物,选择其中三维结构已知的蛋白质作为研究对象,研究了盐桥数目和类型对古细菌和细菌类蛋白质耐热性的影响作用。结果表明:无论古细菌还是细菌类蛋白质,总盐桥含量和盐桥网络都随耐热性的提高而增加;古细菌类超高温蛋白质形成盐桥时对Asp的利用率比较高;细菌类耐热蛋白质形成盐桥时尽量利用带正电荷的Lys和带负电荷的Glu,而常温蛋白质尽量利用带正电荷的His和带负电荷的Asp;由于耐热蛋白质对带电荷氨基酸的利用率高,即使细菌类耐热蛋白质和常温蛋白质含有等量的带电荷氨基酸,其稳定性也会提高。
【关键词】全基因组 蛋白质 耐热性 盐桥
【基金】国家自然科学基金项目(20676053)资助
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
文献传递