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牙鲆MHC class ⅡB基因多态性及其与鱼体抗病力关系的分析

2006-10-30分类号:S917.4

【作者】张玉喜  陈松林  
【部门】中国水产科学院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室  中国水产科学院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室 山东青岛266071  中国海洋大学海洋生命学院  山东青岛266003  山东青岛266071
【摘要】用fmhcN1和fmhcC1引物分别从42尾感病个体和42尾抗病个体的基因组DNA中扩增MHC基因片段,扩增产物长度为268/280 bp。在268/280 bp的核苷酸序列中,有32个(11.4%)核苷酸位点是多态的。在其编码的61个氨基酸位点中,有13个位点是多态的,其中有6个位点发生在多肽结合位点上。对核苷酸替代的类型及位点进行分析,发现非多肽结合位点的非同义碱基替代率与同义碱基替代率的比值(dN/dS)(0.523)远远小于多肽结合位点的非同义碱基替代率与同义碱基替代率的比值(dN/dS)(23.091),表明氨基酸替换集中出现在exon2多肽结合位点上。分析84个个体的411个阳性克...
【关键词】主要组织相容性复合体  MHCⅡ多态性  抗病力  牙鲆
【基金】国家重点基础研究发展规划(973)项目(2004B117403); 国家863项目(2002AA626010); 国家自然科学基金项目(30413240)
【所属期刊栏目】水产学报
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