美洲黑杨雄性花芽cDNA克隆测序及表达序列标签(ESTs)特性分析
2006-11-30分类号：S792.11
【部门】北京林业大学林木花卉遗传育种教育部重点开放实验室 中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室 中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室 中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室 中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室 中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室 北京林业大学林木花卉遗传育种教育部重点开放实验室 北京100083中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室 北京100091 北京100091 北京100091 北京100091 北京100091 北京100091 北京100083
【摘要】采用SMART技术构建美洲黑杨雄性花芽cDNA文库。随机挑选4200个克隆进行序列测定,获得原始序列3092个ESTs,去除插入片段短于150bp的序列和污染序列后,获得有效ESTs序列3087个,平均长度515bp。对聚类后的416个Clusters分别进行单独拼接,得到相应的Contigs和Singletons分别为451和1104个,并通过与NCBI等核酸数据库进行比对、查询和注释,获得已知功能和未知功能的基因1015个,无序列相似性的新基因540个。这些数据为进一步研究高等植物花发育提供了一个极有价值的资源。
【关键词】美洲黑杨 雄性花芽 cDNA文库 表达序列标签
【基金】国家自然科学基金资助项目(30200225)
【所属期刊栏目】林业科学
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