兔病毒性出血症病毒基因组3′端非编码区的分子克隆及生物信息学分析
2006-03-25分类号：S852.65
【部门】浙江省农业科学院 农业部病毒学与生物技术重点实验室 浙江省农业科学院 农业部病毒学与生物技术重点实验室 浙江省农业科学院 农业部病毒学与生物技术重点实验室 浙江省农业科学院 农业部病毒学与生物技术重点实验室 西北农林科技大学 动物科技学院 浙江省农业科学院 农业部病毒学与生物技术重点实验室 浙江省农业科学院 农业部病毒学与生物技术重点实验室 浙江省农业科学院 农业部病毒学与生物技术重点实验室 浙江省农业科学院 农业部病毒学与生物技术重点实验室 浙江省农业科学院 农业部病毒学与生物技术重点实验室 浙江 杭州 310021 浙江 杭州 310021 甘肃农业大学 动物医学院 甘肃 兰州 73007...
【摘要】采用3′RACE方法对兔病毒性出血症病毒(RHDV)JX／CHA／97株基因组3′端全序列进行了扩增、克隆和测序,并利用ONAstar和DNAman软件分析了RHDV JX／CHA／97株与各参比毒株3′NCR的序列同源性,用RNA structure软件对3′NCR的二级结构进行了预测和分析。结果表明,所扩增的目的基因片段长1500 bp,包括部分VP60基因序列、ORF2基因、3′端非编码区(3′Non Coding Region,3′NCR)和poly(A)尾巴,其中 3′NCR位于ORF2终止密码子TAG之后,长59 bp,poly(A)至少含有27个A;3′NCR序列具有较高的同源性...
【关键词】兔病毒性出血症病毒 3′端非编码区 poly(A) 二级结构 生物信息学
【基金】浙江省自然科学基金资助项目(Y305047)
【所属期刊栏目】西北农林科技大学学报(自然科学版)
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