用等位基因特异PCR检测普通小麦(Triticum aestivum L.)的单核苷酸多态性
2006-07-10分类号：S512.1
【部门】西北农林科技大学农学院 国家基因资源与遗传改良重大科学工程/农业部作物种质资源与生物技术重点实验室/中国农业科学院作物科学研究所 西北农林科技大学农学院 国家基因资源与遗传改良重大科学工程/农业部作物种质资源与生物技术重点实验室/中国农业科学院作物科学研究所 杨凌712100国家基因资源与遗传改良重大科学工程/农业部作物种质资源与生物技术重点实验室/中国农业科学院作物科学研究所 北京100081 北京100081 杨凌712100 北京100081
【摘要】【目的】以2份六倍体小麦Opata85和W7984及其重组近交系(RIL)的111个株系和3份小麦二倍体野生近缘种为材料,研究用等位基因特异PCR检测普通小麦中单核苷酸多态性的方法。【方法】利用直接测序的方法检测2份六倍体小麦和3份小麦二倍体野生近缘种TaDREB1基因的DNA序列,在B基因组上发现了2个SNPs。以其为3′端,设计等位基因特异引物及其互补引物,对SNP进行分型,同时研究了特异引物3′端碱基错配对等位基因特异PCR的影响,优化了PCR反应体系。【结果】等位基因特异引物3′端不同位置的碱基错配及不同类型的碱基错配对PCR结果影响较大;在等位基因特异PCR中,Mg2+、dNTP及T...
【关键词】六倍体小麦 单核苷酸多态性 等位基因特异PCR 碱基错配
【基金】国家“863”计划项目(编号:2004AA211102)资助
【所属期刊栏目】中国农业科学
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