【摘要】本文从政府间财政关系的角度分析认为,在基层财政运行困难的背景下,新型农村合作医疗发动困难的深层次矛盾是基层政府的信用缺失。本文进一步将医疗服务提供方的农村基层医疗机构纳入分析框架,研究了不同的基层医疗机构在新型农村合作医疗制度下的利益互动关系。研究认为,乡镇卫生院和村级卫生所是合作医疗的受益机构,其中,乡镇卫生院受益程度最大,村级卫生所的受益程度明显受制于乡镇卫生院。基于实地调研,本文还结合已有的三种补偿机制提出了降低新型农村合作医疗制度发动成本的财政预付模式。