一种基于聚合酶链式反应检测SNP的方法
2006-06-30分类号：Q78
【部门】中国农业大学农学与生物技术学院 中国农业大学农学与生物技术学院 中国农业大学农学与生物技术学院 中国农业大学农学与生物技术学院 中国农业大学农学与生物技术学院 中国农业大学农学与生物技术学院 北京100094 国家玉米改良中心 北京100094 北京100094 国家玉米改良中心 北京100094 北京100094 国家玉米改良中心 北京100094 北京100094 国家玉米改良中心 北京100094 北京100094 国家玉米改良中心 北京100094 北京100094 国家玉米改良中心 北京100094
【摘要】SNP是具有广泛利用潜力的第3代分子标记,本文旨在开发一种利用PCR技术快速检测SNP的方法。设计思路是:根据已知SNP位点设计2条特异正向引物,其最后一个碱基分别与已知SNP的2个碱基相同,同时在1条引物的5′端添加1段20 bp左右的其他物种的特异序列(如细菌DNA序列),然后选择1条合适的反向引物;最后同时加入3条引物,通过梯度PCR选择合适的退火温度进行PCR反应。利用这一方法成功将玉米的ZDS基因定位在玉米第7染色体短臂7.02 Bin。这种检测SNP的方法设计简单,费用低廉,尤其适合SNP标记的分子标记连锁图构建或者基因定位。
【关键词】Allele-CompetitivePCR(AC-PCR) 单核苷酸多态性 基因定位
【基金】国家重点基础研究发展规划项目(2001CB1088); 国家自然科学基金资助项目(30500322)
【所属期刊栏目】中国农业大学学报
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