【摘要】近年来兴起的自由贸易区与世贸组织(WTO)所构建的多边贸易体制产生了诸多冲突,例如对最惠国待遇的侵蚀、争端管辖冲突问题。文章首先介绍了世贸组织与自贸区争端管辖的潜在冲突和协调办法,此后基于世贸组织的实践案件和现行规则对争端管辖冲突问题进行了梳理和总结,并就当前在自贸区谈判中应当如何处理争端管辖冲突问题提出现实建议。