WSSV3个编码蛋白的基因密码子偏爱性分析
2005-08-30分类号：S945.46
【部门】中国水产科学研究院黄海水产研究所 中国水产科学研究院黄海水产研究所 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛266071 青岛266071 青岛266071
【摘要】运用EMBOSS(TheEuropeanMolecularBiologyOpenSoftwareSuite)的CHIPS(Condon HeterozygosityinaProteinCodingSequence)和CUSP(Createacondonusagetable)程序对WSSV3个编码蛋白的基因密码子偏爱性分析,分析结果与大肠杆菌、酵母及人的密码子偏爱性进行比较。结果显示,WSSV vp37、WSSV vp39及WSSV vp19的Nc(Effectivenumberofcondons)值为49.897、48.640、46.868。3种蛋白的编码密码子使用频率有较大的差异,其在大肠杆...
【关键词】WSSV 密码子 偏爱性
【基金】国家重点基础研究项目(G1999012002); 国家自然科学基金(30271020); 中国水产科学研究院项目(200341)资助
【所属期刊栏目】海洋水产研究
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