猪戊型肝炎病毒新疆株swCH25全基因序列的分析
2005-08-10分类号:S852.65
【部门】南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室 南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室 南京210095 南京210095
【摘要】设计18对PCR引物分片段扩增猪戊型肝炎病毒新疆分离株swCH25全基因,对两末端采用末端快速扩增方法(RACE)进行扩增,扩增产物克隆到pMD18-T载体并测序。用DNAstar软件进行序列同源性分析,PHYLIP软件绘制基因进化树,在全基因序列的基础上比较猪HEV与其它HEV基因型的差异和人源HEV的关系。结果显示swCH25全序列除去3′poly(A)尾,由7243个核苷酸组成,ORF1~3分别编码含1070,674和114个氨基酸的蛋白质。全基因序列与HEVⅠ、Ⅱ和Ⅲ型同源性73.5%~75.7%,与Ⅳ型的同源性为83.5%~89.8%,其中与Ⅳ型中国人源T1株最高,达89.8%。OR...
【关键词】戊型肝炎病毒 基因型
【基金】
【所属期刊栏目】中国农业科学
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