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应用PCR-RFLP及PCR-TGGE技术监测农田土壤微生物短期动态变化

2005-09-30分类号:S154.3

【作者】赵勇  李武  周志华  潘迎捷  赵立平
【部门】南京农业大学生命科学学院  上海交通大学生命科学技术学院  上海交通大学生命科学技术学院  上海水产大学食品学院  上海交通大学生命科学技术学院 江苏南京210095  上海水产大学食品学院  上海200090   上海200240   上海200240   上海200090   上海200240
【摘要】在一块农田里于一个月内连续采集5次土样,提取土样微生物总DNA,应用PCR RFLP及PCR TGGE技术监测土壤微生物的动态变化。结果表明,细菌16SrDNA和真菌18SrDNA的PCR RFLP图谱在5个采样时间点上基本一致;细菌的PCR TGGE图谱平均有40条带,其相似性在90%以上,真菌的平均有20条带,其相似性在70%以上。说明这块农田土壤细菌区系短期内变化不大,而真菌区系存在较小幅度的动态变化,并且细菌多样性远远高于真菌多样性。比较两种分子生物学方法的结果表明,PCR TGGE技术比PCR RFLP技术更能精确地反映土壤微生物的动态变化,并且能同时快速地对多个样品进行有效区分。
【关键词】土壤微生物  动态变化  土壤DNA提取  PCR扩增  RFLP分析  TGGE分析
【基金】上海市农委资助项目(2002442;2003152)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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