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表达序列标签数据库搜索克隆斑马鱼QM基因及其数字化差异显示分析

2005-10-30分类号:Q953;

【作者】金红建  邵健忠  项黎新
【部门】浙江大学生命科学学院  浙江大学生命科学学院  浙江大学生命科学学院 浙江杭州310012   浙江杭州310012   浙江杭州310012
【摘要】QM基因是一种与肿瘤抑制、细胞生长、分化、发育和凋亡等有关的重要基因,已在人类及许多物种中得到了克隆,但鱼类中尚无报道。我们利用表达序列标签数据库和电子克隆等技术,成功克隆了斑马鱼QM基因,并对该基因的结构进行了系统分析。结果显示,斑马鱼QM基因cDNA全长769bp,含648bp开放阅读框架,编码215个氨基酸,5’UTR25bp,3’UTR122bp,所编码的QM多肽分子量24.6kDa,等电点(pI)10.6,含潜在的蛋白酶C磷酸化位点、N-酰基化位点和酰胺化位点。比较斑马鱼QM和人等13个物种QM的同源性,发现其氨基酸序列相似性为66%~92%。数字化差异显示分析结果表明,QM基因在斑...
【关键词】斑马鱼  QM基因  表达序列标签  电子克隆  数字化差异显示分析
【基金】国家自然科学基金(30371096,30571423); 浙江省自然科学基金(301307); 高等学校博士学科点专项基金资助(20030335040)
【所属期刊栏目】水产学报
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