北方梭囊孔菌漆酶基因DNA片段的克隆与序列分析
2005-09-30分类号:Q78
【部门】东北林业大学林学院 东北林业大学生命科学学院 东北林业大学林学院 东北林业大学林学院 哈尔滨工业大学生命科学与工程系
【摘要】根据报道的10几种真菌漆酶氨基酸序列的保守区域设计了一对简并引物,以北方梭囊孔菌总DNA为模板,通过PCR扩增到一个1201bp的基因片段.将片段序列在NCBI的BLAST软件上进行同源性搜寻,显示99个序列,全部为漆酶基因及其类似基因,因而认为克隆到的片段就是北方梭囊孔菌漆酶基因片段.经过与同源性最高的粗毛革孔菌(laccaselcc1)同一区段编码区序列进行ClustalW比较,其中有6个间隔区,确定为内含子区.去除内含子后,推导的氨基酸序列为286个残基.经与其他几种真菌漆酶的氨基酸序列进行ClustalW比对,同源性均在51%以上.
【关键词】北方梭囊孔菌 漆酶 简并引物 基因克隆
【基金】国家自然科学基金资助项目(30170775).
【所属期刊栏目】北京林业大学学报
文献传递