应用变性梯度凝胶电泳和16SrDNA序列分析对山羊瘤胃细菌多样性的研究
2004-09-10分类号：S852.2
【部门】南京农业大学消化道微生物研究室 南京农业大学消化道微生物研究室 南京农业大学消化道微生物研究室 瓦赫宁根农业大学微生物系 瓦赫宁根农业大学动物系动物营养研究室 瓦赫宁根农业大学动物系动物营养研究室 南京210095 瓦赫宁根农业大学微生物系 瓦赫宁根农业大学动物系动物营养研究室 荷兰 南京210095 南京210095 荷兰 荷兰
【摘要】以取自3头安装有永久性瘤胃瘘管的土种山羊的瘤胃内容物为材料,经过DNA抽提和PCR扩增,扩增产物利用变性梯度凝胶电泳技术(DGGE,一种DNA指纹技术)分析瘤胃细菌在两种日粮条件下的多样性.同时利用基因序列分析技术,分析了16个在DGGE胶上有匹配带的克隆的16S rDNA序列,并与现有的数据库进行了比较.结果表明,饲喂基础日粮时3头山羊瘤胃内容物的DGGE图谱有一定的相似性(43%～55%);饲料中添加大豆黄酮一定程度上影响了瘤胃细菌的组成,DGGE 谱带变化程度分别为 1 号 36% 、2 号 46% 、3 号 30%。基因序列分析表明,DGGE图谱中优势条带的16S rDNA基因序列中有...
【关键词】山羊瘤胃细菌 遗传多样性 PCR 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 16SrDNA
【基金】自然科学基金资助项目(39870578); 国家杰出青年科学基金资助项目(30025034)
【所属期刊栏目】中国农业科学
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