苹果WRKY基因家族生物信息学及表达分析
2015-08-27分类号:S661.1
【部门】中国农业科学院果树研究所
【摘要】【目的】鉴定苹果(Malus domestica Borkh.)基因组上132个WRKY基因,为研究苹果WRKY转录因子在非生物和生物胁迫以及生长和发育过程中的调控作用奠定相关理论基础,也为进一步分析苹果WRKY基因提供信息。【方法】利用HMMER 3.0软件,通过WRKY保守域全蛋白序列PF03106用于鉴定苹果WRKY基因。采用Web Logo3、DNAMAN 5.0、Map Inspect、MEME和MEGA5.1等软件对其蛋白序列进行生物信息学分析。采用RT-PCR技术检测苹果WRKY基因的组织表达情况。【结果】鉴定得到132个苹果WRKY基因。分组鉴定和进化树分析结果显示,苹果WRK...
【关键词】苹果 WRKY 转录因子 生物信息学 基因家族
【基金】国家自然科学基金(31401852); 国家公益性行业(农业)科研专项(201203034)联系方式:谷彦冰,Tel:0429-3598269; E-mail:guyanbing2010@126.com。冀志蕊,Tel:0429-3598236; E-mail:xinyu_jzr@163.com。谷彦冰与冀
【所属期刊栏目】中国农业科学
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