三倍化复制对白菜花粉特异表达候选基因的影响
2015-09-23分类号:S634
【部门】中国农业科学院蔬菜花卉研究所/农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室 武汉大学生命科学学院/植物发育生物学教育部重点实验室
【摘要】【目的】研究三倍化复制事件后白菜花粉特异表达候选基因的进化情况,为研究白菜的花粉特异表达基因提供理论依据。【方法】利用Syn Orths软件及拟南芥花粉特异表达基因集,通过共线性分析获取白菜中的花粉特异表达候选基因。通过Interpro Scan获取这些候选基因的GO注释,并将这些GO注释划分到与花粉相关的13个大类。然后统计每个GO的基因数占不同拷贝类型基因总数的比例,对不同拷贝类型间进行比较。进一步根据白菜3个亚基因组集,将这些候选基因划分到不同的亚基因组上。通过分析白菜花粉特异表达候选基因中串联重复基因与拟南芥基因的共线性关系,推测这些串联重复基因是在芸薹属特有的三倍化事件之前形成,还是...
【关键词】白菜 花粉特异表达 三倍化复制 共线性 进化
【基金】国家“863”计划(2012AA100101);国家“973”计划(2012CB113906);国家自然科学基金(31272179;31301784)联系方式:王晓波,E-mail:biowangxb@163.com。通信作者王晓武,Tel:010-82105917;E-mail:wangxiaowu@caas.cn
【所属期刊栏目】中国农业科学
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