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从中国对虾ESTs中筛选微卫星标记的研究

2003-06-30分类号:S917.4

【作者】徐鹏  周令华  田丽萍  相建海
【部门】中国科学院海洋研究所  中国科学院海洋研究所  中国科学院海洋研究所  中国科学院海洋研究所 山东青岛 266071   山东青岛 266071   山东青岛 266071   山东青岛 266071
【摘要】利用生物信息学方法在含有10446个中国对虾ESTs的数据库中进行微卫星序列的筛选,共发现微卫星序列229个,占整个ESTs数据库的2.19%,其中含双碱基重复序列146个和3碱基重复序列58个,分别占在ESTs数据库中发现微卫星序列总数的63.76%和25.33%,大部分发现的微卫星序列均为Perfect形式的重复序列。根据筛选得到的微卫星序列设计并合成引物19对进行多态性检测,在有扩增产物的16对引物中,首次筛选得到8个中国对虾微卫星标记,并对这些微卫星标记进行了等位基因频率、观测杂合度、期望杂合度、PIC值等统计学指标的评价。结果表明,在8个微卫星位点上,等位基因的数目从5到15不等,等...
【关键词】中国对虾  表达序列标签  微卫星
【基金】国家重点基础研究发展项目 (G1 9990 1 2 0 0 7); 国家自然科学基金项目 (3 991 0 1 1 3 ); 国家高技术研究发展计划(2 0 0 1AA6 2 1 0 50 )
【所属期刊栏目】水产学报
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