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猪肛门闭锁候选基因FN1的克隆及其编码区突变

2015-02-03分类号:S 852.16+5

【作者】金秋实 刘睿泽 余梅 李小平
【部门】华中农业大学动物科技学院/农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室  武汉 430070
【摘要】利用猪的SNP芯片筛选锁肛致病候选基因,在猪15号染色体候选区域筛选出纤连蛋白1 (fibronectin 1,FN1)基因。分别用锁肛猪和正常猪cDNA池克隆得到FN1基因开放阅读框的7 437 bp序列,鉴定3个选择性剪切外显子,并通过直接测序获得21个编码区单核苷酸多态位点(SNPs)。其中第22外显子的148A>G和第27外显子的50G>C引起氨基酸的改变(1 167Ile>Val,1 435Glu-Asp),且这2个SNPs在现有锁肛猪和正常猪样品中基因型频率和基因频率均差异显著。研究结果提示FN1基因的突变可能影响肛门直肠的正常发育过程,但还需要进一步的功能验证。
【关键词】FN1   肛门闭锁   猪   SNPs
【基金】国家自然科学基金项目(31000995); 教育部留学回国基金项目(52113007)
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
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