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基于Copula函数的权重基因共表达网络分析法

2015-02-03分类号:R 857.3

【作者】汪伟平1  2  白婷3  贺帅1  2  李倩4  胡动刚5
【部门】1.北京师范大学地表过程与资源生态国家重点实验室  北京 100875  2.民政部/教育部减灾与应急管理研究院  北京 100875  3.武汉大学测绘遥感信息工程国家重点实验室  武汉 430079  4.华中农业大学生命科学技术学院  武汉 430070  5.华中农业大学理学院  武汉 430070
【摘要】利用Frank-Copula函数构建相关系数,并应用于权重基因共表达网络分析模型的改进。同时,利用该改进模型分析小鼠基因数据,发现在相关度最大的模块中有67个基因与小鼠肥胖导致的体质量问题相关。其中,模型的筛选结果有效率为62.6%,说明其在功能基因筛选应用前景中的科学性、有效性和可行性。
【关键词】权重基因共表达网格分析   相关系数   Copula函数   小鼠体质量   基因筛选
【基金】国家大学生创新性实验计划项目(1210504024);中央高校基本科研业务费专项(2013RW006); 国家自然科学基金项目(61202305)
【所属期刊栏目】华中农业大学学报
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