药用模式真菌灵芝小G蛋白基因家族的系统性分析
2015-07-10分类号:Q939.96
【部门】南京农业大学生命科学学院/农业部农业环境微生物重点实验室 江苏 南京 210095
【摘要】[目的]利用比较基因组学方法,对药用模式真菌灵芝的基因组中的小G蛋白基因家族成员进行系统的预测分析和比较。[方法]利用真菌物种中已经报道的小G蛋白,对灵芝全基因组进行BLAST分析,筛选出所有灵芝的小G蛋白基因,并分析这些同源小G蛋白的基本特性。通过小G蛋白家族的进化树分析和功能域分析,解析灵芝小G蛋白家族成员的进化关系。设计每一个小G蛋白同源基因的特异性引物,通过荧光定量PCR检测小G蛋白同源基因的表达。[结果]灵芝中发现了29个小G蛋白家族基因,其中Ras亚家族4个,Rho亚家族4个,Rab亚家族12个,Arf亚家族7个,Ran亚家族1个,还有一个线粒体小G蛋白。菌丝体中有28个小G蛋白基...
【关键词】灵芝 小 G 蛋白 功能域分析 荧光定量 PCR
【基金】国家科技支撑计划项目(2013BAD20B05-04);江苏省科技支撑计划项目(BE2014338);江苏省博士后科研资助项目(1402020B);中国博士后科学基金项目(2015M570456)
【所属期刊栏目】南京农业大学学报
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