基于单核苷酸多态性标记的7个斑鳢野生群体的遗传结构和遗传多样性分析
2024-07-15分类号:S917.4
【部门】浙江海洋大学水产学院 中国水产科学研究院珠江水产研究所 上海海洋大学水产与生命学院
【摘要】为探讨斑鳢(Channa maculata)自然分布群体的遗传结构和遗传多样性,基于SLAF简化基因组测序技术检测了斑鳢7个群体(广东阳春、广东化州、广西南宁、广西贺州、湖南江华、福建邵武、台湾台北)的SNP标记,并进行遗传学分析。结果显示,共检测出2502887个SNP位点,平均测序深度为20.19X,平均Q30和GC含量分别为95.31%和41.16%。7个斑鳢群体多态性信息含量(PIC)为0.2672~0.2872,期望杂合度(He)为0.3304~0.3580,观测杂合度(H_o)为0.2145~0.3393,群体遗传多样性处于中等水平。群体间遗传分化指数(Fst)为0.15300~0.78658,基因流(Nm)为0.24118~0.62035,群体间表现出高度遗传分化状态,台北群体与其他6个群体间遗传分化程度极大(Fst>0.5)。群体遗传结构分析表明,7个群体均单独聚类,遗传结构单一。本研究揭示了不同地区野生斑鳢群体的遗传背景和亲缘关系,对斑鳢种质资源的合理利用和遗传育种工作具有重要的参考意义。在后续的育种工作中,应特别关注不同斑鳢群体间的亲缘关系,以期提高斑鳢亲本质量和育种效率。
【关键词】斑鳢 SNP 遗传结构 遗传多样性
【基金】现代农业产业技术体系建设专项(CARS-46);; 中国水产科学研究院基本科研业务费专项(2023TD37,2023SJHX2);; 国家自然科学基金项目(32373127);; 广东省乡村振兴战略专项资金项目(2022-SPY-00-016)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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