紫贻贝(Mytilus galloprovincialis)热硬化过程中耐热相关生物学过程及通路的转录组分析
2024-08-30分类号:S917.4
【部门】国家海洋设施养殖工程技术研究中心 浙江海洋大学海洋科学与技术学院
【摘要】紫贻贝(Mytilus galloprovincialis)的热硬化是为了应对春季连续低潮期的极端低潮而进行的热耐受性提升的一种生存策略。为揭示紫贻贝在热硬化下的热耐受性提升机制,基于转录组测序技术对热硬化组(H)和对照组(N)处理后的贻贝鳃组织进行测序分析。结果显示,相对于对照组,热硬化组有651个差异表达基因,其中有159个显著上调,492个显著下调。GO分析结果显示,差异表达基因显著富集于代谢过程、物质运输、信号转导等生物学过程。进一步对GO分析中的显著富集条目基因集进行GSEA分析,细胞大分子代谢过程、核酸代谢过程、含核碱化合物代谢过程等与大分子代谢、物质代谢、能量代谢相关的生物学过程均表现上调。KEGG分析发现,差异表达基因显著富集于Rap1、细胞凋亡-多物种、MAPK等与代谢调节相关的信号通路。以上研究表明,热硬化紫贻贝可能通过激活多种大分子代谢过程以增强组织的功能发挥能力,同时加强了鳃组织主动清除损伤细胞的能力,为后期高温胁迫做出早期生理调节和适应性反应,使其功能得到更好地发挥。本研究挖掘了与紫贻贝热硬化相关的生物学过程及代谢通路,为研究紫贻贝热硬化形成的分子机制提供了研究基础。
【关键词】紫贻贝 热硬化 转录组测序 大分子代谢 GSEA
【基金】国家自然科学基金面上项目(42076119);; 浙江省“三农九方”科技协作计划“揭榜挂帅”项目(2023SNJF065)
【所属期刊栏目】中国水产科学
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