【摘要】为解析间作相生相克作物对香葱生长及抗性的作用机制，设置C：香葱单作处理、F：相克处理组合（香葱/豌豆间作）和H：相生处理组合（香葱/番茄间作），比较分析香葱间作不同作物对根系内生微生物群落组成的影响。结果显示：unclassified＿f＿Xanthomonadaceae、独岛杆菌属（Dokdonella）、黄杆菌属（Flavobacterium）、unclassified＿f＿Alcaligenaceae、德沃斯氏菌属（Devosia）细菌是香葱间作相生相克作物体系下香葱根系排名前5的共有优势内生细菌属；同时，嗜酸菌属（Acidovorax）细菌是相克处理组合：香葱/豌豆间作体系下，香葱根系中特有的优势内生细菌属。单镰刀菌属（Fusarium）、炭疽菌属（Colletotrichum）、Plectosphaerella、unclassified＿o＿Helotiales、新赤壳属（Neocosmospora）真菌是香葱间作相生相克作物体系下香葱根系排名前5的共有优势内生真菌属；赤霉属（Gibberella）和Acrocalymma属真菌是相生处理组合香葱/番茄间作体系下香葱根系中特有的优势内生真菌属；Dactylonectria和漆斑菌属（Myrothecium）真菌是相克组合处理（香葱/豌豆）间作体系下香葱根系中特有的优势内生真菌属。结果表明，香葱间作不同作物塑造了香葱根系相异的内生微生物群落，香葱间作相生作物体系中，香葱根系中形成了具有促进作物生长、提高作物抗性功能的内生微生物群落；而香葱间作相克作物体系中，香葱根系中形成了以病原微生物为主体的内生微生物群落，这可能是香葱间作不同作物产生相生相克现象的重要机制之一。