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黄缘短头叶蝉线粒体基因组及系统发育分析

2024-07-04分类号:S433

【作者】杨文欣   贺俊芳   田莉莉   王伟   李敏   张斌
【部门】内蒙古师范大学生命科学与技术学院  中国科学院成都生物研究所  太原师范学院生命科学与技术学院  
【摘要】【目的】探究黄缘短头叶蝉(Iassus lateralis)的线粒体基因组结构及叶蝉亚科(Iassinae)的系统发育关系,为叶蝉的分类学、群体遗传学和进化学研究提供参考。【方法】通过高通量测序技术组装、拼接获得黄缘短头叶蝉线粒体基因组全序列,对其进行分析,并基于13个蛋白质编码基因(PCGs)和2个核糖体RNA基因(rRNAs)构建系统发育树。【结果】黄缘短头叶蝉线粒体基因组全长为15 153 bp(GenBank登录号:OQ991898.2),由37个编码基因和1个控制区组成,37个编码基因包括13个PCGs、22个转运RNA基因(tRNAs)和2个rRNAs;碱基组成呈现明显的A+T偏向性;PCGs以ATN或TTG作为起始密码子,以TAA、TAG或T作为终止密码子;13个PCGs编码3 624个氨基酸,其中,脯氨酸(Phe)的含量最多;22个tRNAs中,除trnS1缺失二氢尿嘧啶(DHU)臂外,其余均为典型的三叶草结构。系统发育分析表明,叶蝉亚科内的系统发育关系为:网脉叶蝉族(Krisinimi)单独聚为一支,短头叶蝉族(Iassini)、短板叶蝉族(Hyalojassini)和窄头叶蝉族(Batracomorphini)聚为一支。其中,黄缘短头叶蝉与褐盾短头叶蝉(I.dorsalis)聚为一支。【结论】叶蝉亚科内各族进化关系稳定,黄缘短头叶蝉的分类地位无较大变动,短板叶蝉族的分类地位需要用更多的样本数据进一步确定。
【关键词】黄缘短头叶蝉  叶蝉亚科  高通量测序  线粒体基因组  系统发育
【基金】国家自然科学基金项目(32260122、31760632);; 内蒙古自然科学基金项目(2020MS03014);; 内蒙古自治区科技计划项目(2021GG0112);; 内蒙古师范大学基本科研业务费专项资金(2022JBXC016);内蒙古师范大学研究生科研创新基金项目(CXJJS22121)
【所属期刊栏目】福建农林大学学报(自然科学版)
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