【摘要】党的二十届三中全会明确指出“健全主体功能区制度体系”。文章首先从主体功能区突出资源环境承载力的基础作用、强调发挥区域比较优势、遵循可持续发展目标导向等3个科学内涵出发，评价了主体功能区的政策价值和实施成效，揭示了不同主体功能的区域之间存在突出的发展差距问题。其次，基于经济地理学基本理论和方法，讨论了健全主体功能区制度体系的改革指向，主要包括：建设与高质量发展和中国式现代化建设相适配的主体功能区制度，完善主体功能和叠加功能良性互动的协同发展制度，创建以主体功能区为基础蓝图加快构建国土空间新体系、形成综合功能区布局的制度。最后，还就主体功能高质量发展和健全主体功能区制度体系的改革创新重点，进行了深入讨论。研究认为，经济地理学在主体功能区形成与发展中发挥了重要的科技支撑作用，新时代健全主体功能区制度体系也必将成为经济地理学发展的新动力。