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不同浓度褪黑素缓解狗牙根铅胁迫实时荧光定量PCR内参基因的筛选

2024-08-30分类号:S688.4

【作者】谢程程   马均   李璟   李西
【部门】宜宾职业技术学院文创与旅游学院  四川农业大学风景园林学院  
【摘要】实时荧光定量PCR(Reverse transcription quantitative real-time PCR, qRT-PCR)技术常用于基因表达分析,但其结果的准确性有赖于筛选出稳定表达的内参基因从而对数据进行均一化。为筛选出铅(Pb)胁迫下不同浓度褪黑素处理狗牙根根尖组织稳定表达的内参基因,本研究在前期生理试验基础上,对选用的8个候选内参基因(PP2A、TIP41、CACS、ACT、EF-1α、TUB、UPL7、GAPDH)在6个样本中的表达量进行qRT-PCR分析。结果发现,8个内参基因在不同样本中表达水平存在较大差异,且单个内参基因Ct值在不同样本中变化范围有显著差异。利用ΔCt 算法、NormFinder、BestKeeper和GeNorm程序对内参基因稳定性进行排序,并结合线上工具RefFinder计算得出各内参基因稳定性的综合排名。结果表明,CACS + PP2A为不同浓度褪黑素处理铅胁迫下狗牙根根尖组织最适内参基因组合。该内参基因组合将为解析褪黑素影响狗牙根Pb耐受性和吸收转运的分子机制奠定基础,进一步推动褪黑素在植物修复Pb污染土壤中的实际应用。
【关键词】褪黑素  铅胁迫  实时荧光定量PCR  内参基因
【基金】宜宾市科技计划项目“油樟叶渣生物炭修复土壤重金属污染效能与机制研究”(2022SF001);; 国家自然科学基金面上项目“两种不同污染生态型假俭草对重金属铅吸收、转运及耐性差异机制研究”(31870703)
【所属期刊栏目】草业科学
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