【摘要】【目的】研究樟树“赣彤1号”在不同光质下扦插的变化情况及其生根的分子机制，为全面揭示“赣彤1号”插穗生根机理奠定理论基础。【方法】以扦插后在4种光质下处理不同时间（0、30、68 d）的插穗基部韧皮部组织为材料，观察“赣彤1号”生根形态，同时对其在不同光质和不同时期进行转录组测序，并对其结果进行基因功能注释和差异表达基因筛选。【结果】红光处理下的生根率大于其他3种光质，红蓝光与白光发育进程较为相似，蓝光处理下生根率最低；在生根发育过程中共发现39 026个差异表达基因，其中，上调23 414个，下调15 612个，红光下差异基因最多，上调6484个，下调3902个；GO 富集结果表明，DEGs在次级代谢过程、苯丙醇代谢过程、光合作用、膜锚固构件、叶绿素结合等过程得到显著富集。KEGG结果表明，差异表达基因主要被富集到光合作用、生长素及糖酵解/糖异生等代谢过程。光系统I的氧化还原状态在蓝光下会被抑制，ATP合酶的活性显著下降，蓝光降低了光合作用的效率；糖酵解通路中磷酸葡萄糖酶、果糖-二磷酸醛缩酶等基因在红蓝光下显著上调；在红光及红蓝光下，其生长素水平显著上调。【结论】通过对“赣彤1号”在不同光质下扦插生根的转录组进行分析，结果显示红光下多种基因上调表达，有利于促进其不定根的生长发育。